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理論上，只要遵循INCITS T10技術委員會頒布的SAS-3規範，所有12Gb SAS週邊產品與設備，包括板卡、磁碟機與儲存陣列之間，理應都能相容使用。
不過以我們這幾個月實際接觸與測試12Gb SAS產品的經驗來看，12Gb SAS裝置之間的相容性，還沒有達到可讓用戶隨心所欲任意搭配的程度。我們在測試報導中曾遇到過某一家12Gb SAS 介面卡廠商以無法保證完全相容為由，拒絕搭配非協力廠商的12Gb SAS磁碟陣列進行測試——儘管雙方都是12Gb SAS規格，理應能相容搭配。
我們也曾遇過特定12Gb SAS硬碟與RAID卡及儲存系統搭配使用時，在特定存取情境下會導致RAID群組失效的情況，最後必須依靠硬碟廠商更新硬碟韌體才解決了問題。前述情況顯示，就目前這個12Gb SAS剛開始步入普及階段的時間點，相容性仍是必須注意的問題。
因此我們建議，盡可能採購由儲存供應商提供的整套12Gb SAS系統，由儲存供應商一併提供包括磁碟機到儲存陣列在內的所有設備，以減少遭遇相容性問題的機率。如果要由自己採購週邊裝置，則須特別注意相容性清單，採購搭配RAID卡，或儲存陣列使用的12Gb SAS硬碟時，一定得確定該硬碟在RAID卡與儲存陣列廠商的相容清單中，除了型號、容量須符合相容清單記載外，磁區（sector）格式也必須相符，而不要為了便利而使用不在相容清單中的裝置，才能確保相容性。