如果開發者在GitHub上儲存的專案使用「Docker」作為名稱的開頭，可要小心觸犯Docker的商標權。日前Python開發者Andreas Jung去信詢問Docker公司此問題，Docker法務部門回信建議他最好更改專案的名稱，以免觸犯Docker公司的商標。而以Docker搜尋GitHub上專案，名稱有Docker字母的專案數量超過10萬個，恐怕都有受到波及得改名的可能。
Python開發者Andreas Jung在部落格上發文，他去函Docker公司詢問在GitHub上的開源專案名稱若含有Docker字樣，是否違法。結果他收到Docker法務部門Christopher J. Palermo的來信，建議他最好更改GitHub線上專案儲存庫的名稱。
信件中Christopher J. Palermo表示，Docker並不提供此類用途的授權，他也宣稱，由於Docker是已經進行註冊的商標，「使用Docker開頭命名的儲存庫名稱，必須與Docker公司有關聯，或者是由Docker所贊助的專案。」
Andreas Jung則以推文憤怒地回應：「我們讓Docker名聲大噪，Docker卻反過來告我們，還伸張合理使用權？真是間混蛋公司。」
早在2015年時，Docker也曾要求開發者禁止使用「Docker」一詞作為網域名稱。Christopher J. Palermo在一個名為wharfee的專案的Issue留言，宣稱Docker是經過註冊的商標，禁止在網域最開頭使用Docker一詞。